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概要

フル名
docker.io/bdgenomics/rhapsody
Registry
docker.io
名前空間
bdgenomics
リポジトリ
rhapsody
キャッシュ Tag 数
40
最終同期
07/06/2026, 06:39 AM

概要

BD Rhapsody 单细胞基因组分析流水线镜像，处理 FASTQ 至表达矩阵，适合 HPC 工作站离线批处理分析。

詳細

bdgenomics/rhapsody 封装 BD Rhapsody 生物信息学分析工具链，读取测序数据输出 count matrix。定位为 --rm 生信批处理 CLI，挂载输入/输出目录一次性运行；非常驻 Web 服务，通常在 HPC 或工作站 docker 调度。

快速启动

docker run --rm \
  -v /data/fastq:/input \
  -v /data/output:/output \
  docker.io/bdgenomics/rhapsody:latest \
  rhapsody --input /input --output /output

推荐实践

docker run --rm \
  -v /data/fastq:/input \
  -v /data/output:/output \
  --shm-size=4g \
  docker.io/bdgenomics/rhapsody:2.0.0 \
  rhapsody pipeline --config /input/config.yaml

核心参数说明

  • -v .../fastq:... — 测序输入目录
  • -v .../output:... — 分析结果输出
  • --shm-size=4g — 大内存并行计算
  • 定位 — HPC --rm 批处理

最新 Tag（20 件）

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Tagアーキテクチャプッシュ日時サイズDigest同期期望操作
docker.io/bdgenomics/rhapsody
:latest
linux/amd64
2025/10/29 03:131.3 GBsha256:89b50f70c84a…
docker.io/bdgenomics/rhapsody
:3.0
linux/amd64
2025/10/29 03:131.3 GBsha256:89b50f70c84a…
docker.io/bdgenomics/rhapsody
:2.4b3
linux/amd64
2025/09/11 05:551.3 GBsha256:bd16fdb1dec9…
docker.io/bdgenomics/rhapsody
:2.4b2
linux/amd64
2025/08/19 05:301.3 GBsha256:00ff5669bb41…
docker.io/bdgenomics/rhapsody
:2.4b1
linux/amd64
2025/06/26 04:521.2 GBsha256:b7df3cee4ee8…
docker.io/bdgenomics/rhapsody
:2.3.post3
linux/amd64
2025/05/30 05:471.2 GBsha256:df38a68cedc9…
docker.io/bdgenomics/rhapsody
:2.3.post2
linux/amd64
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docker.io/bdgenomics/rhapsody
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linux/amd64
2025/03/11 06:301.2 GBsha256:e56626bdaf7c…
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linux/amd64
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linux/amd64
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linux/amd64
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linux/amd64
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docker.io/bdgenomics/rhapsody
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linux/amd64
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